B.1.1.7 variación de COVID-19 que se propaga rápidamente en los Estados Unidos

Los resultados, que aparecen hoy en Célula, sugieren que el número de casos futuros de COVID-19 y las tasas de mortalidad en los Estados Unidos serán más altos de lo que hubieran sido de otra manera. El análisis sugiere que la variante, que se ha detectado en una proporción cada vez mayor de muestras de SARS-CoV-2, es un 40-50% más transmisible que las líneas de SARS-CoV-2 dominantes anteriormente. Otros estudios han encontrado evidencia de que la variante B.1.1.7 puede tener aproximadamente un 50% más de probabilidades de causar un COVID-19 fatal.

«B.1.1.7 se ha convertido rápidamente en la variante dominante del SARS-CoV-2 en el Reino Unido y otros países desde que apareció a fines del año pasado, y Estados Unidos ahora está en una trayectoria similar», dice. Kristian Andersen, PhD, coautor principal del estudio, profesor en el Departamento de Inmunología y Microbiología de Scripps Research y director de Genómica de Enfermedades Infecciosas en el Scripps Research Translational Research Institute. «Necesitamos una acción inmediata y decisiva para minimizar la morbilidad y mortalidad de COVID-19».

Además de Andersen, el otro autor principal fue William Lee, PhD, vicepresidente de ciencia en Helix, que proporciona pruebas de COVID-19 basadas en PCR a organizaciones en los Estados Unidos. El estudio también fue escrito por Nicole Washington, PhD, directora asociada de investigación en Helix, y Karthik Gangavarapu de Andersen Lab.

«B.1.1.7 tiene una tasa de duplicación de poco más de una semana y un aumento del 40-50 por ciento en la tasa de transmisión, lo que significa que podría tener un impacto significativo en la salud pública», dice Lee. «Es vital continuar monitoreando la propagación de esta y otras variantes emergentes, pero nuestro nivel actual de vigilancia es inadecuado y está a la zaga del de otros países. Necesitamos un programa nacional de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 más completo. con este. «

La variante B.1.1.7 surgió en el sur de Inglaterra el año pasado y desde entonces se ha convertido en la variante dominante en el Reino Unido. En diciembre, el equipo de Andersen en Scripps Research con colegas de la Universidad de California en San Diego confirmaron la primera evidencia de la variante en California.

Un modelo de dominio

La variante B.1.1.7 contiene varias mutaciones, incluidas varias en el gen que codifica la proteína de pico viral. Estas mutaciones aumentan la capacidad del pico para unirse al receptor ACE2 en las células humanas. Si bien todavía no hay evidencia de que la variante B.1.1.7 pueda evadir las vacunas COVID-19, los funcionarios de salud pública temen que su tasa de propagación relativamente alta empeore significativamente la pandemia antes de que las vacunas puedan ponerle fin.

Las pruebas de hisopado estándar de coronavirus verifican la presencia de secuencias genéticas distintivas en tres sitios del genoma viral; la variante B.1.1.7, debido a sus mutaciones, es positiva para dos de estos sitios, pero negativa para el tercer sitio, que se encuentra dentro del gen espiga del virus.

El nuevo análisis de aproximadamente 500,000 resultados de la prueba Helix de julio de 2020 reveló que este patrón de dos de tres, conocido como falla de la diana del gen S, o SGTF, se hizo constantemente evidente a una frecuencia baja (0.2%) a mediados de octubre. Para la tercera semana de febrero, había aumentado a una frecuencia del 10,6 por ciento y se detectó en pacientes de 25 estados y territorios diferentes en los Estados Unidos.

El patrón SGTF puede ocurrir con otras variantes de SARS-CoV-2 que tienen mutaciones genéticas de pico, pero los investigadores encontraron al secuenciar cada muestra de SGTF que tenían de diciembre a febrero, 662 de las 986 muestras (67%) contenían B.1.1. 7 variante. Esto sugiere que el patrón SGTF en las pruebas de frotis puede proporcionar una indicación rápida, aunque aproximada, de la prevalencia de B.1.1.7.

La variante ha entrado al país muchas veces.

El análisis también indicó que B.1.1.7 desde diciembre ha representado un porcentaje en rápido aumento de los resultados del SGTF, por ejemplo, alcanzando alrededor del 95% en California a mediados de enero. Además de los 659 casos B.1.1.7 detectados mediante el método SGTF, los investigadores encontraron otros tres casos de la variante B.1.1.7 entre las muestras recolectadas como parte de los esfuerzos de vigilancia genómica imparcial del SARS-CoV-2 en California. .

Los 662 casos de B.1.1.7 secuenciados en el estudio provienen de muestras recolectadas en 10 estados de EE. UU., Aunque los investigadores señalan que otros laboratorios de pruebas que cubren un total de 33 estados y territorios de EE. UU. Ahora han informado a los CDC al menos una B. 1.1.7 caso.

El análisis del tipo de árbol genealógico de los investigadores de las secuencias de B.1.1.7 detectadas muestra que la variante se ha introducido en los Estados Unidos varias veces desde al menos fines de noviembre de 2020, particularmente en California y Florida, y en períodos que coinciden con una aumento de viajes, incluida la Semana de Acción de Gracias.

Los científicos también encontraron que la variante, en su conjunto, parece propagarse entre un 40 y un 50% más rápido que las variantes del SARS-CoV-2 que dominaban anteriormente. Estimaron que para la primera semana de febrero de 2021, B.1.1.7 constituía aproximadamente el 4,3% de los casos de COVID-19 en los Estados Unidos, incluido el 4,2% de los casos en California y aproximadamente el 11,5% de los casos en Florida.

El apoyo para el estudio fue proporcionado por los Centros para el Control de Enfermedades de EE. UU. (75D30121P10258, 75D30120C09795), el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (3U19AI135995-03S2, U19AI135995, U01AI151812), los Institutos Nacionales de Salud (UL1TR Front002550) Fondo proporcionado por los Institutos Canadienses de Investigación en Salud.