Investigadores identifican variantes de COVID-19 con potencial para escapar de la respuesta inmune celular – ScienceDaily

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Varias cepas existentes de SARS-CoV-2, así como otras variantes futuras que puedan surgir, tienen el potencial de escapar de la respuesta citotóxica de las células T del sistema inmunitario en algunas partes de la población. Esta es la conclusión de un nuevo estudio de modelado publicado el 10 de febrero un PLOS Biología Computacional por Antonio Martín-Galiano del Instituto de Salud Carlos III, España, y colegas.

La respuesta de las células T en humanos está codificada genéticamente por moléculas HLA, lo que significa que diferentes individuos tienen diferentes HLA, programados para reconocer patógenos invasores en función de diferentes partes o «epítopos» de los patógenos. Con miles de moléculas HLA diferentes en la población humana y miles de epítopos posibles en un virus dado, la evaluación experimental de la respuesta inmune de cada alelo HLA humano a cada variante viral no es factible. Sin embargo, los métodos computacionales pueden facilitar esta tarea.

En el nuevo estudio, los investigadores primero determinaron el conjunto completo de epítopos de una cepa de referencia original de SARS-CoV-2 de Wuhan, China. El equipo descubrió 1222 epítopos de SARS-CoV-2 asociados con los principales subtipos de HLA, que cubren aproximadamente el 90 % de la población humana; al menos 9 de cada 10 personas pueden lanzar una respuesta de células T a COVID-19 basada en estos 1222 epítopos.

Luego, los investigadores analizaron computacionalmente si alguno de los 118,000 aislamientos diferentes de SARS-CoV-2 de todo el mundo, descritos en un conjunto de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), tenía mutaciones en estos epítopos. Mostraron que el 47% de los epítopos habían mutado en al menos un aislado existente. En algunos casos, los aislamientos existentes tenían mutaciones en múltiples regiones de epítopos, pero las mutaciones acumuladas nunca afectaron a más del 15 % de los epítopos para un tipo dado de alelo HLA. Cuando el equipo analizó los alelos susceptibles y el origen geográfico de sus respectivos aislamientos de escape, descubrió que coexistían en algunas regiones geográficas, incluidas África subsahariana y el este y sudeste de Asia, lo que sugiere una posible presión genética sobre la respuesta de los linfocitos T citotóxicos en estos áreas

«La acumulación de estos cambios en aislamientos independientes aún es demasiado baja para amenazar a la población humana mundial», dicen los autores. «Nuestro protocolo ha identificado mutaciones que pueden ser relevantes para poblaciones específicas y justifican una vigilancia más profunda».

Sin embargo, Martín-Galiano apunta que «las mutaciones del SARS-CoV-2 no detectadas» pueden en el futuro «amenazar la respuesta T citotóxica en las subpoblaciones humanas».

Fuente de la historia:

Materiales proporcionados por OLP. Nota: El contenido se puede cambiar por estilo y longitud.

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