La transmisión del coronavirus en Queens causó la primera ola de pandemia en la ciudad de Nueva York, según un estudio

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Los distritos más poblados de la ciudad de Nueva York, Queens y Brooklyn, probablemente sirvieron como el centro principal de COVID-19 generalizado en la primavera de 2020, encuentra un nuevo estudio.

Dirigida por investigadores de la Facultad de Medicina Grossman de la Universidad de Nueva York, la nueva investigación analizó más de 800 muestras genéticas del coronavirus para rastrear el camino del virus a su paso por la ciudad de Nueva York durante la primera ola mortal de la pandemia. Identificó Queens y, en menor medida, Brooklyn como el punto de origen probable para la mayoría de los casos muestreados, con más casos circulando dentro de sus fronteras y extendiéndose desde estas partes de la ciudad hasta Manhattan y los distritos exteriores que en la otra dirección. .

«Nuestros hallazgos parecen confirmar el papel de Queens como un epicentro temprano de la transmisión del coronavirus en el resto del área metropolitana de Nueva York», dice el coautor principal del estudio Ralf Duerr, MD, PhD. «Ahora que entendemos cómo los brotes virales pueden propagarse entre los vecindarios, podemos planificar mejor para futuras infecciones y priorizar las pruebas en las áreas más vulnerables».

Duerr, profesor investigador en el Departamento de Patología de Langone Health de la NYU, señala que si una enfermedad similar al coronavirus afecta nuevamente a la ciudad de Nueva York, probablemente podría seguir el mismo camino básico en la región.

Si bien se necesita más investigación para identificar las razones detrás de la propagación, los investigadores del estudio sospechan que los desplazamientos probablemente desempeñaron un papel clave. Duerr señala que el 35 por ciento de los trabajadores de Queens y Brooklyn viajan a Manhattan todos los días en automóvil, metro y autobús. Además, los dos principales aeropuertos de la ciudad, LaGuardia y JFK, se encuentran en Queens. El hecho de que los afroamericanos e hispanoamericanos, particularmente afectados por la pandemia, utilicen desproporcionadamente el transporte público y vivan en estos dos distritos puede haber sido otro factor posible, dice Duerr.

Estudios anteriores han revelado que el coronavirus echó raíces por primera vez en Nueva York a fines de febrero de 2020, con más de cien fuentes separadas de brotes que estallaron en cadenas de infección en lugar de un solo «paciente cero». Sin embargo, la dinámica de la propagación viral dentro y entre distritos individuales seguía sin estar clara.

El nuevo estudio, publicado el 20 de mayo en la revista PLOS patógenos, fue diseñado para rastrear con precisión la propagación del coronavirus dentro de los cinco distritos de la ciudad de Nueva York y Long Island durante la primera ola de la pandemia, según Duerr.

En la secuenciación de genes, los investigadores comparan pequeños fragmentos del código genético para identificar mutaciones que se encuentran solo en una cepa particular del virus. Estas «banderas», dicen los investigadores, se pueden usar para mapear cuándo y dónde se han extendido las cepas a lo largo del tiempo, de manera similar a las pruebas utilizadas para rastrear la ascendencia en las personas. Los expertos han utilizado previamente esta técnica para seguir los brotes de influenza, Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (MRSA) y Ébola, entre otros brotes.

Para la nueva investigación, los investigadores analizaron la información genética viral obtenida de cientos de hisopos nasales. Las muestras fueron tomadas de hombres y mujeres que dieron positivo por COVID-19 en la ciudad de Nueva York y Long Island de marzo a mayo de 2020. Usando las diferentes banderas de mutación, la fecha en que se recolectaron las muestras y los códigos postales de los pacientes, el Los investigadores del estudio crearon simulaciones por computadora que rastrearon el camino del virus en la región. La investigación se llevó a cabo en el Genome Technology Center de NYU Langone.

Descubrieron que ocho de cada 10 simulaciones apuntaban a Queens como el foco principal de propagación viral en la primera ola de infección. Mientras tanto, las otras dos simulaciones han identificado a Brooklyn y el Bronx como el epicentro de la pandemia, respectivamente, lo que, según los autores del estudio, sugiere que estos dos distritos desempeñaron papeles importantes, aunque más pequeños, en la transmisión viral en toda la ciudad.

Investigaciones anteriores se han basado en datos de hospitalización para inferir cómo viajó el brote. Los nuevos hallazgos, dicen los autores del estudio, proporcionan un mapa más directo del movimiento de las infecciones.

«Estas técnicas de secuenciación de genes y modelado por computadora pueden ser utilizadas por cualquier comunidad que busque monitorear cómo se puede propagar un virus cuando las pruebas masivas y el rastreo de contactos son limitados», dice la autora principal del estudio, Adriana Heguy. PhD.

Heguy, profesor del Departamento de Patología de Langone de la NYU, alienta a otros funcionarios de salud pública en los Estados Unidos y en el extranjero a utilizar estos métodos para mapear cómo la pandemia se ha extendido también a sus ciudades.

Dice que el equipo de investigación planea aplicar los métodos utilizados en la investigación para estudiar la propagación del coronavirus durante la segunda ola de la pandemia en la ciudad de Nueva York.

Los fondos para el estudio fueron proporcionados por las subvenciones de los Institutos Nacionales de Salud U01 Al152151 y R01 AI122953. El apoyo adicional a la investigación provino del Fonds National de la Recherche Scientifique, la Fundación de Investigación – Flandes y los fondos internos de KU Leuven en Bélgica. El Consejo Sudafricano de Investigaciones Médicas ha proporcionado más apoyo.

Además de Duerr y Heguy, otros investigadores de NYU Langone incluyeron a Matthew Maurano, PhD; Sitharam Ramaswami, PhD; Paul Zappile, MS; y Christian Marier, BSc. Otros co-investigadores del estudio fueron Simon Dellicour, PhD; Samuel Hong, BA; Bram Vrancken, PhD; Guy Baele, PhD; y Mandev Gill, PhD, de la Universidad de Lovaina en Bélgica; Antoine Chaillon, MD, PhD, de la Universidad de California en San Diego; y Gordon Harkins, PhD, de la Universidad de Western Cape en Sudáfrica.

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