Nuevo procedimiento para promover la medicina de precisión basada en la genómica – ScienceDaily

Los hallazgos, codirigidos por el Instituto Garvan de Investigación Médica y publicados hoy en Genética de la naturaleza, representan un importante paso adelante para la medicina de precisión basada en genómica y podrían ayudar a identificar marcadores que revelen qué pacientes se beneficiarán más de qué tratamiento.

«En este estudio hemos proporcionado una visión completamente nueva de la regulación genética al descubrir una imagen en profundidad de cómo se relacionan los genes y las enfermedades. Es el análisis más completo de cómo la variación genética humana afecta la expresión génica hasta la fecha», dice. El coautor principal, el profesor asociado Joseph Powell, director del Centro Garvan-Weizmann de Genómica Celular y subdirector del Instituto de Futuros de Genómica Celular de la UNSW.

«Nuestro descubrimiento ofrece a los investigadores una perspectiva completamente nueva sobre sus genes de interés y ayudará a priorizar los genes que pueden ser más relevantes para la intervención terapéutica. También puede llevarnos a mejores marcadores para rastrear la progresión y la eficacia de la enfermedad», dice el co -autor, profesor Lude Franke del Centro Médico Universitario de Groningen, Países Bajos.

Nueva información sobre la actividad de los genes.

Para estudiar cómo la variación genética humana afecta nuestro riesgo de enfermedad, los investigadores a menudo llevan a cabo estudios de asociación de todo el genoma, que escanean los genomas de los pacientes y buscan variantes genéticas más comúnmente asociadas con una condición específica.

Pero interpretar estos resultados no es fácil: en lugar de impulsar directamente la enfermedad, muchas variantes genéticas regulan la actividad de los genes, lo que influye en la cantidad de proteína producida. Al identificar estas regiones reguladoras, conocidas como loci de rasgos de expresión cuantitativa (eQTL), los investigadores pueden comprender mejor qué genes contribuyen directamente al riesgo de enfermedad y cuáles podrían ser atacados con tratamientos de precisión.

En este estudio, los investigadores utilizaron algoritmos especializados de aprendizaje automático para analizar datos genómicos de muestras de sangre de 31.684 personas.

«Gracias al poder estadístico de este gran conjunto de datos, pudimos descubrir nuevas regiones reguladoras en el genoma humano», dice el profesor asociado Powell. «En lugar de simplemente catalogar las posiciones de los genes reguladores adyacentes (conocidos como Estás ahí-eQTLs), pudimos revelar genes que modulan la actividad de genes más distantes (conocidos como trans-eQTL) «.

De los millones de genes que estudiaron, los investigadores encontraron que no solo el 88% tenía una Estás ahí-eQTL, pero que el 32% de los genes también tenían un transEl efecto eQTL se adentra más en el genoma, más de la mitad del cual podría atribuirse a impactos biológicos, como enfermedades cardiovasculares e inmunes.

Descubrir nuevos vínculos genómicos con la enfermedad.

«Si bien está claro que las variantes genéticas son casi siempre una causa fundamental de la enfermedad, el mecanismo por el cual afectan la enfermedad es mucho menos claro. Por ejemplo, mientras que una condición específica puede estar relacionada con cientos de variantes genéticas, la gran mayoría contribuye. a la enfermedad regulando la actividad de los genes «, dice el profesor asociado Powell.

«Comprender qué genes ‘converge’ con esta regulación será invaluable para identificar objetivos para posibles nuevos medicamentos. Si una compañía farmacéutica desarrolla una terapia que se dirige a una molécula en particular, nuestro recurso puede ayudar a identificar cómo se regula su expresión y si el trasfondo genético de varios es probable que los pacientes afecten su eficacia «, añade. «Lo que hemos descubierto es un nivel completamente nuevo de información genómica que proporciona una comprensión más profunda de la biología y la enfermedad».

El recurso está disponible para los investigadores a través de www.eqtlgen.org.